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SUMMARY:Développement d’inhibiteurs peptidiques du virus de la grippe
DESCRIPTION:Benoît SEPARI (IRIG / IBS) \n\n\nLa grippe saisonnière cause la mort de centaines de milliers d’individus chaque année\, tandis que les souches zoonotiques provoquent régulièrement de graves pandémies. Le haut taux de mutation du génome viral limite l’utilisation d’antiviraux ciblant directement influenza\, il est donc nécessaire de développer de nouvelles molécules ciblant des mécanismes viraux ou cellulaires différents et ayant un faible potentiel de mutation. Les antiviraux dirigés contre l’hôte ne cible pas le virus mais plutôt des protéines de l’hôte nécessaires à la réplication du virus\, ainsi\, l’apparition de résistance est beaucoup moins probable. Nous avons donc développé des peptides qui bloquent l’assemblage d’un complexe protéique accessoire du spliceosome humain. Ce complexe est essentiel pour le prolifération du virus car il catalyse l’épissage des ARNs pré-messagers du segment NS en ARNm codant pour les protéines NS1 et NEP. Ce complexe protéique comprend les protéines RED et SMU1\, interagissant directement avec la polymérase virale. La rupture de l’interaction entre RED et SMU1 inhibe l’épissage des pré-ARNm de NS\, sans qu’aucun effet sur la viabilité cellulaire ne puisse être détecté. Des bibliothèques de 10^8 peptides différents ont été conçues\, en étudiant la structure du complexe RED-SMU1 sauvage et en imitant un domaine de fixation naturel de RED. Les peptides les plus affins pour SMU1 ont été sélectionnés par phage display. Des peptides supplémentaires ont également été générés par une approche bioinformatique utilisant un neural network. Les peptides les plus prometteurs ont été caractérisés par ELISA et NGS\, puis des méthodes biophysiques\, structurales et cellulaires ont permis d’identifier des peptides ayant une affinité de l’ordre du nanomolaire pour SMU1 tout en présentant des motifs différents.​\n​\n​ \n\n\n\nL’accès au campus EPN nécessite un avis de rendez-vous. Merci d’adresser votre demande à ibs.seminaires@ibs.fr au moins 48h à l’avance.\nN’oubliez pas de vous munir d’une pièce d’identité.
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SUMMARY:Juan FONTECILLA-CAMPS (IBS / Groupe Métalloprotéines)
DESCRIPTION:Exaptation : la composante opportuniste de l’évolution et de la sélection naturelle\nRésumé : \nLa variété et la capacité fonctionnelle des êtres vivants ont toujours intrigué les biologistes. Le philosophe grec Aristote était\, il y a plus de 2300 ans\, le premier à classifier les animaux selon la couleur de leur sang. Il croyait aussi que les mêmes animaux avaient existé\, immuables\, depuis une éternité. Il a fallu attendre le XIXe siècle pour que Charles Darwin explique l’évolution des espèces par la sélection naturelle. Cette évolution peut paraître linéaire et\, pour certains\, elle aurait un but (téléologie). Mais pour les évolutionnistes il n’y pas de plan ni de finalité. Un des résultats fondamentaux de la sélection naturelle est l’adaptation ; une fois qu’un organe est devenu utile\, les mutations aléatoires qui améliorent sa fonction seront sélectionnées parce qu’elles sont avantageuses. Mais la sélection naturelle opère aussi de manière opportuniste\, et un organe donné peut se transformer pour remplir une fonction complètement différente de celle d’origine ; c’est l’exaptation. Un cas classique est la transformation d’écailles de dinosaures en plumes d’oiseaux. Pendant mon séminaire je vais illustrer plusieurs cas d’exaptation biologique\, et discuter aussi l’exaptation culturelle. \nContact : ibs.seminaires@ibs.fr \n  \n 
URL:https://sfp-alpes.fr/event/exaptation-la-composante-opportuniste-de-levolution-et-de-la-selection-naturelle/
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SUMMARY:Nidia MALDONADO CARMONA (University of Florence\, Italy)
DESCRIPTION:Bringing light to pathogens : light-driven strategies for disinfection of pathogens\nAbstract : \nThe emergence of antimicrobial resistance has prompted the search for new strategies\, aiming to find more efficient ways to kill microbial pathogens. In this sense\, Photodynamic Antimicrobial ChemoTherapy (PACT) uses a combination of light\, oxygen and a photosensitizer molecule to produce lethal reactive oxygen species\, which have demonstrated to be highly effective against microorganisms and even against multiresistant microorganisms. During this talk\, I will address the different challenges that surround the field\, ranging from an efficient delivery of photosensitizers using natural biopolymers\, while also addressing the delivery of light into a clinical scenario model\, addressing the difficulties of biological experiments with\ntwo-variables to juggle with\, technical challenges that hinder the application of this technique into the clinic. \nContact : appaixfl@univ-grenoble-alpes.fr
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LOCATION:IAB – Salle de séminaire\, IAB Site Santé - Allée des Alpes\, La Tronche\, 38700\, France
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SUMMARY:David SKURNIK (Hôpital Necker- Enfants Malades\, Université Paris Cité)
DESCRIPTION:New approaches in vaccine development\nRésumé : \nHigh-throughput sequencing and particularly original applications such as the TnSeq allow a study of host-pathogen interaction at the full genome scale through a systematic analysis off all the virulence factors of a bacteria in a particular setting. For example\, all the genes important or essential for GI tract colonization of the selected pathogenic bacteria. \nThis allows to reveal new targets for vaccine development. Interestingly\, an ongoing adaptation of the TnSeq allows the systematic identification of these antigens of interest. We call this new technology : TnVaccine. \nContact : ibs.seminaires@ibs.fr
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LOCATION:IBS – Salle des séminaires\, IBS 71 avenue des Martyrs\, Grenoble\, 38042\, France
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SUMMARY:Delphine ROPERS (Inria – Grenoble)
DESCRIPTION:Computational analyses of bacterial mRNA decay\n  \nPlus d’informations : https://bi-gre.github.io/ \nContact : lucie.lamothe@univ-grenoble-alpes.fr
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LOCATION:IMAG – Salle de Réunion\, 150 place du Torrent\, St Martin d’Hères\, 38400\, France
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SUMMARY:Youngsuk KIM (Pusan National University\, Busan\, South Korea (visiting scientist @ DCM))
DESCRIPTION:Carbene–CS2 : Redox-active Radical Ligands\nContact : david.martin@univ-grenoble-alpes.fr
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LOCATION:DCM – Salle C209\, DCM - Bât Chimie Recherche 301 rue de la Chimie\, St Martin d'Hères\, 38400\, France
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SUMMARY:Sharlen MOORE (Johns Hopkins University\, Baltimore\, USA)
DESCRIPTION:Revealing abrupt transitions from goal-directed to habitual behavior\nRésumé : \nA fundamental tenet of animal behavior is that decision-making involves multiple ‘controllers.’ Initially\, behavior is goal-directed\, driven by desired outcomes\, shifting later to habitual control\, where cues trigger actions independent of the motivational state. Clark Hull’s question from 1943 still resonates today: “Is this transition [to habit] abrupt\, or is it gradual and progressive?” Despite a century-long belief in gradual transitions\, this question remains unanswered as current methods cannot disambiguate goal-directed versus habitual control in real time. Here\, we introduce a novel ‘volitional engagement’ approach\, motivating animals by palatability rather than biological need. Providing less palatable water in the home cage reduced motivation to ‘work’ for plain water in an auditory discrimination task compared to water-restricted animals. Using quantitative behavior and computational modeling\, we found that palatability-driven animals learned to discriminate as quickly as water-restricted animals but exhibited state-like fluctuations when responding to the reward-predicting cue-reflecting goal-directed behavior. After thousands of trials\, these fluctuations spontaneously and abruptly ceased\, with animals always responding to the reward-predicting cue. In line with habitual control\, post- transition behavior displayed motor automaticity\, decreased error sensitivity (assessed via pupillary responses)\, and insensitivity to sensory-specific outcome devaluation. Bilateral lesions of the habit-related dorsolateral striatum (DLS) blocked transitions to habitual behavior. Finally\, we used bilateral fiber photometry in the putative controllers of goal-directed (dorsomedial striatum\, DMS) and habitual (DLS) behavior to monitor the evolution of neural activity across learning. Both the DMS and DLS exhibited learning- related signatures in cue\, lick\, and outcome-related signaling at similar timescales in parallel. Immediately after transitioning to habitual behavior\, outcome-related signaling was suppressed in the DLS and\, to a lesser extent\, in the DMS\, while cue-evoked responses further sharpened. This abrupt shift (reduction in outcome signaling and sharpening of cue-evoked responses) suggests that sensory cues rather than outcomes drive habitual responding. Our results demonstrate that both controllers (DMS and DLS) exhibit learning-related plasticity in parallel but that the behavioral manifestation of habits emerges spontaneously and abruptly in a DLS-dependent manner\, suggesting the involvement of a higher-level process that arbitrates between the two. \nContact : robin.magnard@univ-grenoble-alpes.fr
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LOCATION:GIN – Amphi Serge Kampf\, Grenoble Institut des Neurosciences (GIN) Bât. Edmond J. Safra\, Chemin Fortune Ferrini CHU\, La Tronche\, 38700\, France
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